Las intrigas palaciegas, las aventuras de Gonzalo de Montalvo por encontrar sus orígenes y las situaciones de comedia protagonizadas por Sátur regresan a la parrilla de La 1 de TVE, aunque por primera vez en tres años la serie cambiará su día de emisión y pasará a ocupar la franja de máxima audiencia de los lunes. En su tercera temporada, Águila Roja se presenta con varias novedades, entre las que destaca la incorporación de las actrices Lydia Bosch, Manuela Velasco y Mónica Cruz. La primera interpretará el papel de Madre Isabel, una abadesa de gran carácter y con fama de hacer milagros que llega a la corte llamada por el Rey, que espera que obre un milagro en la enfermedad de su hijo sin saber los oscuros intereses que mueven realmente a este personaje, mientras que Manuela Velasco interpretará el papel de Eugenia, una aristócrata moderna para su época y que se presenta como la prometida de Juan; Mónica Cruz, por su parte, se meterá en la piel de Mariana, la valiente mujer de un célebre pirata inglés que no dudará en arriesgar su vida para poner a salvo la de su marido.

En esta tercera entrega, la historia de Águila Roja dará un giro cuando el protagonista, Gonzalo de Montalvo, descubra nuevos datos sobre su pasado que lo pondrán sobre la pista sobre sus verdaderos orígenes.